W 1 odcinku 1 sezonu Jack Sylvane zostaje postrzelony na cmentarzu, ale kiedy przybywa do drugiego Alcatraz, nie ma śladów po postrzale.
W 6 odcinku 1 sezonu na dokumentach z zatrzymania Petty'ego, które przegląda Madsen po ponownym zamknięciu mężczyzny, widnieje data 3 września 1959 roku, Petty jednak zaczął organizować zamachy bombowe dopiero w roku 1960.
W 9. odcinku serialu, naczelnik więzienia (Jonny Coyne) podnosi sztabkę złota jedną ręką i nie wkładając w to żadnego wysiłku. Biorąc pod uwagę wielkość sztabki, nie powinno to być tak łatwe, ponieważ obecnie standardowa sztabka waży blisko 12 i pół kilograma. Serialowe złoto ma pochodzić z czasów wojny secesyjnej, sztabka więc powinna być taka samo duża jak dzisiaj albo nawet większa.
Choć naczelnik więzienia jest Amerykaninem, w wielu scenach aktor grający go (Jonny Coyne) mówi z brytyjskim akcentem, zdradzającym jego londyńskie pochodzenie.
Zdjęcia do serialu były kręcone w więzieniu Alcatraz na wyspie Alcatraz, a także w San Francisco (Kalifornia, USA) oraz w Vancouver i North Vancouver (Kanada).
Okres zdjęciowy trwał od 7 do 9 lutego 2011 roku (odcinek pilotowy) oraz od 16 sierpnia 2011 roku do 19 stycznia 2012 roku.
Choć akcja toczy się na Alcatraz i w San Francisco i tam właśnie sfilmowano pilot serialu, producenci zdecydowali nakręcić resztę zdjęć w Vancouver, ponieważ Kanada oferuje o wiele dogodniejsze warunki, również finansowo, niż stan Kalifornia czy samo San Francisco.